микросателлиты

Данные о генетическом разнообразии востребованы в селекции и семеноводстве сельскохозяйственных культур. В настоящее время для оценки генетического разнообразия практически всех выращиваемых культур и, в частности, сои, широко применяются молекулярные методы. Наиболее распространенным и предпочтительным, является анализ микросателлитных локусов (SSRSimple Sequence Repeats) так как это наиболее быстрый и дешевый способ генотипирования. Он обладает высокой точностью, надежностью и хорошей воспроизводимостью результатов. Ранее во ВНИИМК были подобраны 9 микросателлитных локусов и на их основе создана система маркеров для идентификации и паспортизации сортов, линий и гибридов сои. Которая использовалась на практике, для создания генетических паспортов всех существующих и вновь созданных сортов сои селекции ВНИИМК. Однако, с увеличением количества анализируемых образцов, некоторые не удавалось различить. Так же, при массовом использовании этих маркеров обнаружилось, что некоторые SSR-локусы менее полиморфны или не дают ожидаемых продуктов ПЦР. Поэтому в настоящем исследовании мы изучали генетический полиморфизм 40 сортов сои разного происхождения с использованием нового набора из восьми SSR-маркеров. Для проведения анализа были отобраны из базы данных праймеры, ограничивающие тринуклеотидные повторы. В результате эксперимента в изученной группе сортов было выявлено 39 аллелей, что в среднем составило 4,88 аллеля на локус. Среднее эффективное число аллелей было 2,94. Индекс полиморфного информационного содержания 0,69. В целом большинство маркеров были высоко полиморфными (со значением PIC выше 0,5). Для каждого сорта получены уникальные ДНК профили, позволяющие различать и идентифицировать их. Выявлен внутрисортовой полиморфизм некоторых сортов сои, который необходимо учитывать при создании молекулярно-генетических паспортов. Кластерный анализ отразил гетерогенность изученной выборки сортов. Все сорта распределились в два кластера. Максимальный уровень различия между генотипами составил 3,75, минимальный – 0,95. Наиболее близкое генетическое родство наблюдалось между сортами Зара и Весточка, что подтверждалось их родословными. Изученный набор микросателлитных локусов может использоваться для анализа генетического разнообразия генотипов сои, а также будет применяться при разработке эффективной технологии молекулярно-генетической идентификации и паспортизации сортов сои.

Для оценки генетического разнообразия сельскохозяйственных культур широко применяются молекулярные методы. Цель исследований – изучение молекулярно-генетического полиморфизма микросателлитов ДНК сортов культурной сои Дальневосточного региона, выявление генетического сходства на основе SSR-анализа и степени генетического родства. Методом ПЦР-анализа с использованием 9 микросателлитных локусов (Satt681, Sat_263, Satt141, Satt181, Satt1, Satt2, Satt5, Satt9 и Soyhsp176) идентифицированы 8 сортов сои дальневосточной селекции и 3 образца сои корейской селекции. На основании выявленного набора аллелей микросателлитных локусов составлены молекулярно-генетические паспорта и построена дендрограмма, характеризующая степень генетического родства 4 сортов сои хабаровской селекции, 4 сортов сои приморской селекции и 3 образцов сои корейской селекции. Кластерный анализ отразил гетерогенность изученной выборки сортов сои. Выявлена высокая генетическая неоднородность сортов сои хабаровской и приморской селекций и образцов сои корейской селекции. Установлены уникальные аллели по локусам для корейской селекции – А137, D148, E126; для приморской селекции – В146, С150, С142, D197, E120, E96; для хабаровской селекции – D176, D154, E105, F256, H165, J135, K208. Обнаружены аллели по локусам Satt9 (D168, D186), Satt681 (F244), Sat_263 (H125), Satt141 (J158) и Satt181 (K218), которые характерны для корейской и приморской селекций, что может свидетельствовать о близости их происхождения. Полученные результаты в перспективе можно использовать в селекционных программах по созданию новых адаптивных сортов сои для Дальневосточного региона.