Данные о генетическом разнообразии востребованы в селекции и семеноводстве сельскохозяйственных культур. В настоящее время для оценки генетического разнообразия практически всех выращиваемых культур и, в частности, сои, широко применяются молекулярные методы. Наиболее распространенным и предпочтительным, является анализ микросателлитных локусов (SSRSimple Sequence Repeats) так как это наиболее быстрый и дешевый способ генотипирования. Он обладает высокой точностью, надежностью и хорошей воспроизводимостью результатов. Ранее во ВНИИМК были подобраны 9 микросателлитных локусов и на их основе создана система маркеров для идентификации и паспортизации сортов, линий и гибридов сои. Которая использовалась на практике, для создания генетических паспортов всех существующих и вновь созданных сортов сои селекции ВНИИМК. Однако, с увеличением количества анализируемых образцов, некоторые не удавалось различить. Так же, при массовом использовании этих маркеров обнаружилось, что некоторые SSR-локусы менее полиморфны или не дают ожидаемых продуктов ПЦР. Поэтому в настоящем исследовании мы изучали генетический полиморфизм 40 сортов сои разного происхождения с использованием нового набора из восьми SSR-маркеров. Для проведения анализа были отобраны из базы данных праймеры, ограничивающие тринуклеотидные повторы. В результате эксперимента в изученной группе сортов было выявлено 39 аллелей, что в среднем составило 4,88 аллеля на локус. Среднее эффективное число аллелей было 2,94. Индекс полиморфного информационного содержания 0,69. В целом большинство маркеров были высоко полиморфными (со значением PIC выше 0,5). Для каждого сорта получены уникальные ДНК профили, позволяющие различать и идентифицировать их. Выявлен внутрисортовой полиморфизм некоторых сортов сои, который необходимо учитывать при создании молекулярно-генетических паспортов. Кластерный анализ отразил гетерогенность изученной выборки сортов. Все сорта распределились в два кластера. Максимальный уровень различия между генотипами составил 3,75, минимальный – 0,95. Наиболее близкое генетическое родство наблюдалось между сортами Зара и Весточка, что подтверждалось их родословными. Изученный набор микросателлитных локусов может использоваться для анализа генетического разнообразия генотипов сои, а также будет применяться при разработке эффективной технологии молекулярно-генетической идентификации и паспортизации сортов сои.